Глава́ администра́ции (губерна́тор) Краснода́рского кра́я — высшее должностное лицо Краснодарского края, формирует и возглавляет администрацию Краснодарского края. Срок полномочий 5 лет, не более двух сроков подряд. 24 августа 1991 года указом президента РСФСР Бориса Ельцина главой администрации Краснодарского края был назначен Василий Дьяконов, народный депутат РСФСР, бывший глава концерна «Кубаньуниверсалмонтаж». Он стал первым губернатором России, назначенным Ельциным сразу после августовского путча 1991 года. 30 июня 1992 года в Краснодаре внеочередная сессия крайсовета приняла постановление о кризисе исполнительной власти в крае и выразила недоверие Дьяконову. 9 декабря того же года указом президента он был отправлен в отставку. 23 декабря 1992 года с согласия Краснодарского краевого совета народных депутатов президент РФ назначил главой администрации края Николая Егорова, первого заместителя главы региональной администрации, председателя краевого правительства. 16 мая 1994 года Егорова перевели в Москву на пост министра РФ по делам национальностей и региональной политике (отправлен в отставку в 1995 года после событий в Буденновске Ставропольского края). 2 августа того же года руководителем Краснодарского края стал глава Курганинского района Евгений Харитонов.
15 июля 1996 года он был освобождён от должности, а на пост главы края вновь назначен Николай Егоров, возглавлявший на тот момент Администрацию Президента РФ. 19 сентября 1996 года наименование высшего должностного лица региона изменилось на «глава администрации (губернатор) Краснодарского края». 21 февраля 1996 года Законодательное собрание Краснодарского края назначило дату первых прямых выборов главы администрации на 27 октября. В выборах 27 октября 1996 года приняли участие десять кандидатов, включая действующего главу края Николая Егорова, а также бывшего руководителя администрации Кубани Василия Дьяконова. По итогам голосования больше всего избирателей поддержали первого заместителя гендиректора ОАО «Краснодарглавснаб» Николая Кондратенко (57,17%). Егоров оказался на втором месте с результатом 24,75 %, третье место занял президент ОАО «Кубаньхлебпродукт» Виктор Крохмаль (7,79%). Против всех высказались 2,30 %. Однако явка составила 43,29 %, что ниже необходимого порога в 50 %. В итоге выборы были признаны несостоявшимися и в крае назначены повторные выборы. Повторные выборы состоялись 22 декабря.
На пост главы края баллотировались семь кандидатов. Победу на выборах одержал Николай Кондратенко (82% голосов), выдвинутый группой избирателей при поддержке КПРФ и Народно-патриотического союза. Второе место занял Виктор Крохмаль (7,18 %), действующий губернатор Егоров стал третьим с результатом 4,83 %, против всех проголосовали 1,92 %. Явка составила 48,63 %. 5 января 1997 года Кондратенко вступил в должность сроком на четыре года. 3 декабря 2000 года состоялись очередные выборы губернатора Краснодарского края. Срок полномочий главы региона составлял четыре года, на пост баллотировались три кандидата. Победу одержал депутат Государственной думы РФ Александр Ткачёв — 81,78 % голосов. За его ближайшего соперника, генерального директора ООО «Спецэнергосервис» Игоря Крамаренко, проголосовали 5,23 % избирателей. Оба кандидата были выдвинуты на выборы группами избирателей. Против всех проголосовали 7,09 %, явка составила 46,73 %. Инаугурация избранного губернатора состоялась 5 января 2001 года. Следующие выборы главы региона прошли 14 марта 2004 года, они были совмещены с выборами президента РФ. Срок полномочий губернатора составлял пять лет.
В выборах участвовали четыре кандидата. Главой администрации (губернатором) Краснодарского края был переизбран Ткачёв, получивший поддержку 83,98 % избирателей. За начальника управления здравоохранения и социальной работы краевого филиала федерального ГУП «ВПК-Инвест» Александра Бондаренко проголосовали 3,36 % (был выдвинут ЛДПР), против всех — 7,62 %. В выборах приняли участие 63,13 % избирателей. 30 марта на заседании Законодательного собрания края Ткачёв официально вступил в должность губернатора Кубани. 11 декабря 2004 года президент РФ Владимир Путин подписал федеральный закон, согласно которому в России начал действовать новый порядок избрания губернаторов: главу региона по представлению президента утверждал местный законодательный орган. 10 апреля 2007 года Ткачёв написал заявление с постановкой вопроса о доверии на имя президента РФ Владимира Путина. 20 апреля президент внёс его кандидатуру на рассмотрение Законодательного собрания Краснодарского края для наделения полномочиями главы администрации региона. 23 апреля депутаты заксобрания утвердили Ткачёва на посту губернатора на очередной пятилетний срок (за — 59, против — 1). В тот же день он вступил в должность.